三軍總醫院是全國第一家全院通過 ISO 9001:2000年版品質管理系統認證的醫學中心，其鑑於資訊科技應用一日千里，藉由醫療資訊導入、輔助與控管，極力追求卓越成效以達到「品質的三軍總醫院」，所以一直以來就非常致力於導入ISO制度。
據軍聞社報導，三軍總醫院通過國際驗證ISO/CNS 27001「資訊安全管理系統（ISMS）」驗證，於今日(25日)獲頒ISO27001：2005及CNS27001：2007(TAF認證)資訊安全(Information Security Management System)證書，代表三總資訊安全管理系統符合國際標準。
通過國際驗證機構的授證，三軍總醫院期盼能夠提供民眾安全、完整的資訊服務，展現維護民眾個資安全的決心，並藉此提升整體的醫療品質，讓三總成為全國軍民心中的首選醫院。