新版個資法自公告以來，一直爭議不斷，主因在於法條中有許多待釐清的名詞，這些模糊空間造成市場對個資法條的解讀莫衷一是。法務部長官認為，未來一旦法規正式上路，問題將會更多，像是各產業要如何訂定安全維護標準？企業是否知道該怎麼做？各種問題都需要經過專業評估才能解決，如今市場把關注焦點圍繞在法條定義與解釋上，只能治標而已，根本解決之道乃是成立專責機構。
該長官進一步指出，目前新版個資法的問題核心不在於如何解釋法條，而是缺乏一個專責機構。借鏡歐洲國家的經驗來看，當初在制定個資法的時候，因為有很多新的概念與作法，故以「成立專責機構」作為配套措施，負責法條解釋、處理爭議、制定管理要點…等相關事宜，而台灣立法時以歐洲為標準，制定了非常嚴格的法條規範，卻沒有一個專責機構，才會導致現今爭議不斷、大家各自解讀的狀況。
至於亞洲國家，包括日本、韓國、香港、澳門、馬來西亞、菲律賓、新加坡等國，不是已經有就是即將成立個資保護專責機構。以日本為例，最初將非公務機關的個資保護事宜，交由消費者廳來管轄，如今卻決定設立專責機構，菲律賓與新加坡也在2012年成立專責委員會，處理個資法相關事宜，另外，紐西蘭與澳大利亞也都設專責機構且運行超過20年以上。
再者，個資法將公務機關與非公務機關放在同一個規範框架裡，但是公務機關沒有專責主管機關，由各單位組織自行負責，倘若某一個單位洩露個資，該由誰來懲處？這個問題恐怕無解，再就非公務機關來看，雖然法條中明訂由目的事業主管機關負起監督管理之責，但並非每個行業都有相對應的目的事業主管機關，對於一些比較難認定的產業（如：電話行銷業），該怎麼辦？
由此可見，成立個資保護專責機構顯然有其必要性，與其不斷爭論法條如何解讀（更何況未來法規上路後，問題也不會只有法條解釋而已），不如思考如何突破現狀、成立專責機構，才能徹底解決個資法爭議，落實「促進個資合理利用」的立法目的。